Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHDC4Q8TBB5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KLHDC4Q8TBB5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KLHDC4Q8TBB5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KLHDC4Q8TBB5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KLHDC4Q8TBB5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KLHDC4Q8TBB5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KLHDC4Q8TBB5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KLHDC4Q8TBB5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KLHDC4Q8TBB5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KLHDC4Q8TBB5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KLHDC4Q8TBB5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KLHDC4Q8TBB5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KLHDC4Q8TBB5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms