Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX2-3Q8TAU0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKX2-3Q8TAU0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NKX2-3Q8TAU0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NKX2-3Q8TAU0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NKX2-3Q8TAU0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX2-3Q8TAU0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX2-3Q8TAU0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NKX2-3Q8TAU0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NKX2-3Q8TAU0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NKX2-3Q8TAU0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NKX2-3Q8TAU0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NKX2-3Q8TAU0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NKX2-3Q8TAU0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NKX2-3Q8TAU0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NKX2-3Q8TAU0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NKX2-3Q8TAU0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NKX2-3Q8TAU0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NKX2-3Q8TAU0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NKX2-3Q8TAU0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NKX2-3Q8TAU0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms