Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL4L1Q8NHW4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL4L1Q8NHW4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms