Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATL2Q8NHH9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL2Q8NHH9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL2Q8NHH9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms