Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ5

TNIP2, TNFAIP3-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2Q8NFZ5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNIP2Q8NFZ5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP2Q8NFZ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms