Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL2Q8NEU8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms