Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHLHE23Q8NDY6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE23Q8NDY6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE23Q8NDY6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms