Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NHLRC2Q8NBF2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms