Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM229BQ8NBD8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM229BQ8NBD8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms