Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAX2

KDF1, Keratinocyte differentiation factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDF1Q8NAX2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDF1Q8NAX2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDF1Q8NAX2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDF1Q8NAX2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDF1Q8NAX2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDF1Q8NAX2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDF1Q8NAX2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms