Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG16L2Q8NAA4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG16L2Q8NAA4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms