Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC29Q8NA56 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC29Q8NA56 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms