Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNTD1Q8N9Z9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD1Q8N9Z9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNTD1Q8N9Z9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms