Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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DTX3Q8N9I9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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DTX3Q8N9I9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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DTX3Q8N9I9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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DTX3Q8N9I9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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DTX3Q8N9I9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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DTX3Q8N9I9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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DTX3Q8N9I9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DTX3Q8N9I9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DTX3Q8N9I9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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