Protein–RNA interactions for Protein: Q8N819

PPM1N, Probable protein phosphatase 1N, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1NQ8N819 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1NQ8N819 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPM1NQ8N819 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms