Protein–RNA interactions for Protein: Q8N715

CCDC185, Coiled-coil domain-containing protein 185, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC185Q8N715 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC185Q8N715 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC185Q8N715 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC185Q8N715 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.8 ms