Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C8

LILRA3, Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LILRA3Q8N6C8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA3Q8N6C8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LILRA3Q8N6C8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA3Q8N6C8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA3Q8N6C8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA3Q8N6C8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA3Q8N6C8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA3Q8N6C8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA3Q8N6C8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA3Q8N6C8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA3Q8N6C8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA3Q8N6C8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA3Q8N6C8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA3Q8N6C8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA3Q8N6C8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LILRA3Q8N6C8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms