Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
VWDEQ8N2E2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
VWDEQ8N2E2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
VWDEQ8N2E2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VWDEQ8N2E2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms