Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00528Q8N1L1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 330.6 ms