Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPC2Q8N158 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC2Q8N158 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC2Q8N158 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms