Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHOT2Q8IXI1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOT2Q8IXI1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms