Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN4BQ8IWT1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCN4BQ8IWT1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN4BQ8IWT1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms