Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC6Q8IVU3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERC6Q8IVU3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms