Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT12Q8IV01 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT12Q8IV01 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT12Q8IV01 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT12Q8IV01 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT12Q8IV01 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT12Q8IV01 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT12Q8IV01 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms