Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC3FQ8IUX4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3FQ8IUX4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms