Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRLF3Q8IUI8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRLF3Q8IUI8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRLF3Q8IUI8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms