Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RASSF3Q86WH2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF3Q86WH2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF3Q86WH2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms