Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PBRM1Q86U86 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PBRM1Q86U86 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PBRM1Q86U86 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PBRM1Q86U86 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PBRM1Q86U86 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PBRM1Q86U86 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC38.58■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PBRM1Q86U86 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
PBRM1Q86U86 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
PBRM1Q86U86 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms