Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4DQ86TL0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4DQ86TL0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms