Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
HECW1Q76N89 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HECW1Q76N89 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HECW1Q76N89 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.45■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
HECW1Q76N89 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms