Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYS1Q717R9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms