Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PREX2Q70Z35 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PREX2Q70Z35 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PREX2Q70Z35 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PREX2Q70Z35 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms