Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00336Q6ZUF6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00336Q6ZUF6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms