Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC129Q6ZRS4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC129Q6ZRS4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms