Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNG9

KRBA2, KRAB-A domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA2Q6ZNG9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRBA2Q6ZNG9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRBA2Q6ZNG9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRBA2Q6ZNG9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms