Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCARA5Q6ZMJ2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCARA5Q6ZMJ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms