Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CXCL17Q6UXB2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCL17Q6UXB2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCL17Q6UXB2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCL17Q6UXB2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms