Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCE3

PGM2L1, Glucose 1,6-bisphosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM2L1Q6PCE3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGM2L1Q6PCE3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGM2L1Q6PCE3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGM2L1Q6PCE3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms