Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKN3Q6P5Z2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKN3Q6P5Z2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKN3Q6P5Z2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms