Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K8

GTF2H2C, General transcription factor IIH subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2CQ6P1K8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H2CQ6P1K8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTF2H2CQ6P1K8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2H2CQ6P1K8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms