Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NANOGP8Q6NSW7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NANOGP8Q6NSW7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NANOGP8Q6NSW7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms