Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC9A4Q6AI14 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC9A4Q6AI14 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A4Q6AI14 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms