Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT39Q6A163 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT39Q6A163 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT39Q6A163 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT39Q6A163 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT39Q6A163 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT39Q6A163 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT39Q6A163 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT39Q6A163 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT39Q6A163 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT39Q6A163 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT39Q6A163 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT39Q6A163 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT39Q6A163 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT39Q6A163 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT39Q6A163 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT39Q6A163 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT39Q6A163 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT39Q6A163 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT39Q6A163 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT39Q6A163 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT39Q6A163 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT39Q6A163 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT39Q6A163 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT39Q6A163 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms