Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUPD1Q68J44 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DUPD1Q68J44 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms