Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CREB3L3Q68CJ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CREB3L3Q68CJ9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CREB3L3Q68CJ9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms