Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYY2

LIPM, Lipase member M, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPMQ5VYY2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIPMQ5VYY2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIPMQ5VYY2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIPMQ5VYY2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms