Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ECM29Q5VYK3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECM29Q5VYK3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECM29Q5VYK3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms