Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUD1Q5VV17 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 3366.5 ms