Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACHD1Q5VU97 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms