Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4DIPQ5VU43 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4DIPQ5VU43 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4DIPQ5VU43 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4DIPQ5VU43 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4DIPQ5VU43 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4DIPQ5VU43 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PDE4DIPQ5VU43 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE4DIPQ5VU43 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4DIPQ5VU43 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms